产生抗癌化合物的海洋无脊椎动物的微生物群

黑色素瘤(最危险的皮肤癌类型)的治疗方法是否可以是源自生活在海底的无脊椎动物的化合物?由Alison Murray博士领导的一组科学家。里诺(Reno)沙漠研究所(DRI)的研究人员就这么认为，他们正在寻找一种名为Synoicum adareanum的南极海生微生物的微生物组，以更好地了解开发黑色素瘤特异性药物的可能性。

海鞘或“海鞘”是原始的，类似于囊的海洋动物，它们生活在世界各地的海洋底部，并通过过滤海水以浮游生物为食。在南极洲周围水域中的小殖民地生长的金黄色葡萄球菌含有一种名为“ Palmerolide A”的生物活性化合物，具有抗黑素瘤的特性-研究人员认为，该化合物是由与阿拉伯链霉菌。

在本月发表在《海洋药物》杂志上的一篇新论文中，Murray和来自南佛罗里达大学，洛斯阿拉莫斯国家实验室以及法国南特大学的合作者提出了重要的新发现，这些发现测量了从南极洲的Anvers采集的样品中的棕榈油内酯水平。群岛群岛，并表征组成金黄色葡萄球菌微生物群的细菌群落。

穆雷说：“我们的长期目标是弄清该物种中许多细菌中的哪一种正在产生棕榈油内酯，但是要做到这一点，我们需要了解很多关于金莲花沙门氏菌的微生物。”“我们的新研究描述了过去几年中我们在实现该目标方面取得的许多进步。”

2008年，Murray与南佛罗里达大学的Bill Baker博士和DRI博士后研究员Christian Riesenfeld博士合作，发表了关于单个金丝桃的微生物多样性的研究。他们的这项新研究建立在这项研究的基础上，通过表征从安弗斯岛周围收集的63个不同个体的微生物多样性来表征。

他们的结果确定了研究人员所说的物种的“核心微生物组”-一套普通的21种细菌分类群存在于80%以上的样本中，而6种细菌分类群则存在于所有63种样本中。

穆雷说：“这是南极科学界的关键“第一”，因为它能够在相当大的区域研究这些生物的过程中找到并鉴定出这一核心微生物组。“这是我们需要进行下一步以确定棕榈油内酯生产者的信息。”

南极科学以及大自然中天然产物研究的另一个“第一”是对所有63个样品中棕榈油内酯水平的比较，结果表明该化合物在每个标本中的含量都很高(毫克每克标本组织)，但是研究人员没有发现站点，样本或微生物组细菌之间的趋势。对大型数据集上的分类单元的共现关系进行的其他分析显示了细菌相互相互作用以及与该海洋生态系统中的宿主物种相互作用的一些方式。

默里说：“微生物组本身在其他海生动物中的组成是独特的，并且看起来很有趣，并且具有很多相互作用。”“我们的研究为理解该系统的生态打开了大门。”

从研究人员已经鉴定为构成金黄色葡萄球菌核心微生物组的细菌的组合中，他们接下来希望使用基因组学方法最终确定哪些细菌在产生棕榈油内酯-这是朝着重要的方向和需要取得的进展黑色素瘤治疗的发展。

默里说：“使用这种化合物开发抗黑素瘤的药物将是非常重要的，因为目前只有很少的药物可用于治疗它。”“如果我们能够识别出产生这种化学物质的细菌，并且能够通过其基因组了解如何在实验室环境中进行培养，那么这将使我们能够提供可持续的棕榈油内酯供应，而这将不依赖于在南极洲采集该物种的野生种群。 ”。